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R 超入門

R は統計用パッケージとして近年著しく発展，普及してきている．R は GNU ライセンスに従うフリーソフトウェアで，一般的なOSすべてで走る．また他の SPSS や SAS と異なって，R はプログラミング言語として開発されていて，柔軟な処理が可能である．そのため，さまざまな専門領域のユーザーたちによって，分野に特化したライブラリが開発されていることも大きな特徴である．

環境変数 PATH を設定する

設定の理由： R はインタラクティブに使うことができて，そのベースで解説されている本も多い．が，ちゃんと使おうと思ったら，スクリプト（インタプリタのシンプルなプログラムをこう呼ぶ）のソースをエディタで書いて実効すべきだ．そのためには，R のアイコンをクリックして起動するだけではなく，ターミナル上で動かせるようにする必要がある．Mac と Linux の場合にはインストール時に環境変数の設定まで行われるが，Windows の場合にはそうならないので，別途設定を行う．

［コントロールパネル］→［システムとセキュリティ］→［システム］ →［詳細設定］→［環境変数の設定］でメニューを開き，下の図のように

 
	;C:\R\R-3.1.0\bin\x64

を追加する．

インストールの目標(Windows)

Windows 以外のOSでは，

ターミナルから R --vanilla とタイプして次のような表示が出れば，インストールできている．英語が表示されるかもしれないが，それでも問題はない．

      2014/14:39:13> R

      R version 3.1.0 (2014-04-10) -- "Spring Dance"
      Copyright (C) 2014 The R Foundation for Statistical Computing
      Platform: x86_64-apple-darwin13.1.0 (64-bit)

      R は、自由なソフトウェアであり、「完全に無保証」です． 
      一定の条件に従えば、自由にこれを再配布することができます． 
      配布条件の詳細に関しては、'license()' あるいは 'licence()' と入力してください． 

      R は多くの貢献者による共同プロジェクトです． 
      詳しくは 'contributors()' と入力してください． 
      また、R や R のパッケージを出版物で引用する際の形式については 
      'citation()' と入力してください． 

      'demo()' と入力すればデモをみることができます． 
      'help()' とすればオンラインヘルプが出ます． 
      'help.start()' で HTML ブラウザによるヘルプがみられます． 
      'q()' と入力すれば R を終了します．

これはRのインタラクティブモードで，Ruby の irb みたいなものと思えばいい．

R コンソールのアイコン (Mac) (Win) (Ubuntu) もインストール時に生成するが，これは使わないほうが後々のためにはよい。 Windows では次のように操作する。

Windows の場合には，ターミナルで Rgui & と打つと次のような起動画面が現れる。

終り方

終了するには次のように q() と入力すればよい。すると問い合わせが表示される（されないこともある）．それには n で答えておこう．意味がわかるようになったら y でもよい．

      > q()
      Save workspace image? [y/n/c]: n

インタラクティブモード(R コマンダー)で R をいじってみる

代入(オブジェクトの生成)

代入してオブジェクトを生成するには <-を使う． = でも使えることがあるが，場合によってはそうでないので，正しい方を使おう．

      > x <- 125
      > str <- "ABC"

オブジェクトの表示

代入されたオブジェクトを表示するには，単にその名前をタイプすればよい．

      > x
      [1] 125
      > str
      [1] "ABC"

R のオブジェクトは配列のような振る舞いをする．

次のようにして複数のデータを結合できる．(オブジェクトの表示は特に書かないが，そのつどやってみること)．

      > x <- c(10,20,30)

配列の添字は Ruby (C,Java) とちがって 1 からスタートすることを確認．

      > x[1]
      > x[2]

次の例を実行して， 2:10の形の意味を知ろう．

      > x <- c(2:10)

次を実行すると，オブジェクトの表示はどうなるだろうか？行頭の [1] とか [19] のような表示は何を意味するか？

      > x <- c(1:100)

上の解説：オブジェクト表示の行頭に示される [1] のような記号は，行の先頭のデータが何番目であるかを示している．オブジェクトが 1個であっても，それは要素数１の配列のようなものであることがわかる．

データの演算

四則演算や関数はすべてのデータに対して実行される．総和，平均，分散，標準偏差など，データ集合に対して適用される関数もある．

      > x <- c(1,2,3,4)
      > x + 10
      > x * 3
      > sqrt(x)
      > sum(x)
      > mean(x)
      > var(x)

次の例を試して意味を考えよう．

      > x <- c(1,2,3,4)
      > y <- c(3,4,5,6)
      > x + y
      > x * y

      > x <- c(1,2,3,4,5)
      > y <- c(3,4,5,6)
      > x + y
      > x * y

複数のデータの集合を合併する

次の操作の意味を考えよう．とくに c とcbind の違いはどうか？ cbind されて生成するオブジェクトはどんな性質を持つか?

	> Age <- c(19,21,17) 
	> Height <- c(160,165,152) 
	> Weight <- c(58,61,49) 
	> A <- c(Age, Height, Weight)
	> B <- cbind(Age, Height, Weight)
	> A
	> B
	> B[1,]
	> B[2,]
	> B[,1]
	> B[,2]

スクリプトでRのプログラムを動かす

スクリプトのテンプレート

R をインタラクティブモードで動かすのは，最初は楽でも本格的な用途では面倒だ（Ruby のプログラムを irb だけでやるなんてことはしないよね？）．ソースファイルに R の処理を書いて実行するほうが当然楽だ．なお，この種のプログラムは，しばしば「スクリプト」と呼ばれる． R のスクリプトを書くには次のことに留意しよう．

拡張子は .R を使う．小文字の ".r" でも差し支えないが，たった１字なので大文字のほうがわかりやすい．
シバンは次のように．
```
	    #! /usr/bin/env Rscript
	    
	  
```
コメントは，行頭に入れる時は， ## のようにシャープを２つ使う．実はひとつでもコメントとして機能するのだが， Emacs の ESS モードとの相性はそのほうがよい．
日本語を使う場合には，データファイルの文字コードに合わせる．
通常使われる日本語のエンコーディングは， Windows の場合 Shift-JIS (cp932) で， Mac や　Linux では UTF-8 が主流である． R のスクリプト，データファイル，あと忘れやすいことだが，ターミナルのエンコーディングも統一して実行しないといけない．
実行はふつうに．
```
	    > ./hogehoge.R
	    
```

上のデータ操作をスクリプトに書いて実行して見よう．

	Age <- c(19,21,17) 
	Height <- c(160,165,152) 
	Weight <- c(58,61,49)
	B <- cbind(Age, Height, Weight)

	B ## 
	## この後でいろいろ試してみよう．
	## 上の３人の年齢，身長，体重について，総和，平均，標準偏差を求めよ．

情報源

R のインストール(RjpWiki)